这首诗以细腻的笔触描绘了修行者在禅坐中的内心世界与外在景象的交融。首句“一串穿来草子儿。光似牟尼，圆似牟尼。”以“草子儿”象征修行者所持的佛珠，其光亮与形状都如同佛教中的宝珠——牟尼，暗示着内心的纯净与光明。接着，“蒲团坐破念阿弥。”描述了修行者长时间盘坐在蒲团上，不断诵念“阿弥陀佛”，体现了对佛性的追求和内心的专注。

“光放支提，花散军持。”进一步描绘了修行者心灵之光的释放，如同佛塔（支提）的光芒照耀，同时，周围的花朵（军持）也仿佛被这光芒所散播，象征着慈悲与智慧的传播。这一句通过自然界的美好景象，映射出修行者内心的平和与喜悦。

“百八声中一念疑。”则揭示了修行过程中的挑战与思考，百八声代表了佛珠的数目，意味着修行者在不断的诵念中，偶尔会生起疑惑或杂念，这是修行路上不可避免的部分。然而，“不著虚空，即堕贪痴。”强调了修行者不应被这些杂念所左右，否则就会陷入空无的虚幻或是贪欲与痴迷之中，失去了修行的本意。

最后，“若为心似净琉璃。水静鱼游，两不相知。”以净琉璃比喻清澈的心灵，如同水面平静时，鱼儿悠游其中而彼此不知，形象地表达了修行者达到心灵纯净的状态，内心如镜般清明，外界的纷扰与自我之间达到了和谐统一，达到了一种超脱世俗的境界。

整体而言，这首诗通过生动的比喻和深刻的哲理，展现了修行者在追求精神净化过程中所经历的内心变化，以及最终达到的超越世俗、心灵宁静的境界。